Le père de Thomas Bond Sprague était Thomas Sprague (né vers 1801), papetier. Sa mère était Ellen Sprague (née vers 1801). Thomas Bond Sprague avait six frères et sœurs plus jeunes: Mary (née vers 1831), William (née vers 1833), Robert (née vers 1834), John (née vers 1835), Frances (née vers 1837) et Caroline (née vers 1839). Thomas Bond Sprague a épousé Margaret Vaughan Steains, fille de James Steains, le 13 avril 1859 à St Mary, Edge Hill, Lancashire. Ils ont eu six enfants (Mary, Margaret, James, William et Alfred)